0
Dostępne testy
Hodowla bakteryjna
- Izolacja żywego organizmu
- Rodzaje próbek: kał, treść jelitowa
- Zalety:
- Bakterie łatwo rosną w 1 dzień
- Łatwe do wykonania w dowolnym laboratorium (w tym we własnym zakresie)
- Stosunkowo niski koszt
- Wady:
- Niektóre E. coli są częścią normalnej flory jelitowej
- Świnie mają wiele bakterii E. coli w tym samym czasie
- U świń wcześniej leczonych antybiotykami wynik hodowli bakteryjnej może być ujemny
Wrażliwość na środki przeciwdrobnoustrojowe
- Testuje zdolność żywych organizmów do wzrostu in vitro w określonych stężeniach różnych środków przeciwdrobnoustrojowych
- Rodzaje próbek: kał, treść jelitowa
- Zalety:
- Identyfikacja wrażliwości lub oporności określonego izolatu na powszechnie stosowane środki przeciwdrobnoustrojowe
- Identyfikacja trendów oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe
- Wady:
- Wymaga izolatu bakteryjnego
- Testy in vitro mogą nieznacznie różnić się od wyników in vivo
- Niektóre specyficzne środki przeciwdrobnoustrojowe mogą nie być testowane lub wymagać oddzielnych, specjalnych testów
- Średnio wysoki koszt
Histopatologia
- Ocenia obecność zmian tkankowych (uszkodzenia), które mogą potwierdzić obecność choroby. Czasami może również wykryć obecność organizmów bezpośrednio (bakterie i pasożyty) lub pośrednio (wirusy) poprzez dodatkowe specjalne barwienie.
- Rodzaje próbek: tkanka
- Zalety:
- Powiąże adhezję bakterii z uszkodzeniem jelit
- Nie wymaga specjalnego barwienia
- Wady:
- Konieczność utrwalenia tkanek jelitowych w formalinie w ciągu <15 min od śmierci świni -tkanka jelitowa szybko się rozkłada
- Choroba może mieć charakter segmentowy, dlatego należy przesłać wiele próbek jelit
Genotypowanie
- Technika reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), która wykrywa obecność określonej sekwencji kwasów nukleinowych (DNA) związanej ze znanymi genami wirulencji.
- Plusy:
- Wykonanie poprzez PCR; proste do zrobienia
- Pomaga zidentyfikować patogenność poprzez wykrywanie obecności genów (niekoniecznie ekspresji genów) związanych z czynnikami zjadliwości
- Geny toksyn: EAST1, LT, STa, STb, Stx1, Stx2, Stx2e
- Geny fimbrialne: F18, F41, K88 (F4), K99 (F5), 987P (F6)
- Geny adhezyny: AIDA, EAEA, PAA
- Pomaga w prawidłowym doborze szczepionki (dopasowaniu odpowiednich fimbrii)
- Pomaga potwierdzić, że izolat ma geny odpowiedzialne za chorobę obrzękową
Geny E. coli wykryte za pomocą genotypowania PCR i ich funkcja. Geny zaznaczone na czerwono są ważne w diagnozowaniu choroby obrzękowej.
| Gen | Typ | Opis |
|---|---|---|
| EAST1 | Toksyna | Toksyna jelitowa wiąże się z tym samym receptorem i stymuluje tę samą ścieżkę wydzielniczą co Sta (przyczyna biegunki nie jest dobrze poznana) |
| LT | Toksyna | Toksyna jelitowa stymulująca wydzielanie jelitowe |
| STa | Toksyna | Toksyna jelitowa stymulująca wydzielanie jelitowe głównie u młodych świń (zmniejsza wchłanianie wody i elektrolitów) |
| STb | Toksyna | Toksyna jelitowa stymulująca biegunkę wydzielniczą, głównie u starszych świń (zwiększa wydzielanie z enterocytów) |
| Stx1 | Toksyna | Tę toksynę jelitową można znaleźć w szczepach patogennych i niepatogennych |
| Stx2 | Toksyna | Toksynę jelitową można znaleźć w szczepach patogennych i niepatogennych |
| Stx2e | Toksyna | Toksyna ogólnoustrojowa, która indukuje uszkodzenie naczyń i chorobę obrzękową |
| F18 (F107) | Adhezyna | Fimbrie przyczepiające się do jelit, który są obecne po 20. dniu życia i często wiąże się z biegunkami po odsadzeniu i chorobą obrzękową |
| F41 | Adhezyna | Fimbrie używane do adhezji głównie u noworodków |
| K88 (F4) | Adhezyna | Fimbrie używane do adhezji od urodzenia we wszystkich grupach wiekowych |
| K99 (F5) | Adhezyna | Fimbrie używane do adhezji głównie u noworodków |
| 987P (F6) | Adhezyna | Fimbrie używane do adhezji głównie u noworodków |
| AIDA | Adhezyna | Niefimbrialne „adhezyny zaangażowane w rozproszone przyleganie” częściej spotykane w połączeniu z F18 |
| EAE | Adhezyna | Adhezyna niefimbrialna, która przyczynia się do powodowania szeregu zmian patologicznych jelit |
| PAA | Adhezyna | Adhezyna niefimbrialna, niezbędna do tworzenia szeregu zmian patologicznych |
- Wady:
- Wymaga izolatu bakteryjnego
- Mamy nadzieję, że genotypowany jest właściwy izolat (świnie mogą mieć wiele izolatów jednocześnie)
- Umiarkowana cena, ale zwykle testuj tylko 1 izolat
Interpretacja wyników:
Hodowla bakteryjna:
- Musi być hemolityczna E. coli
Rycina 1. Czysta hodowla hemolitycznej bakterii E. coli na płytce agarowej z krwią. Zwróć uwagę na czystą strefę wokół każdej kolonii bakteryjnej, wskazującą na hemolizę (rozkład krwi w agarze płytkowym). Zdjęcia: Iowa State University, Weterynaryjne Laboratorium Diagnostyczne, Sekcja Bakteriologii - Czystość:
- Czysty wzrost: wysoce sugerujący przyczynę choroby
- Wzrost mieszany: wątpliwa wartość
- Ilość- wzrost bakterii:
- Liczne: wysoce sugerujący przyczynę choroby
- Umiarkowane: zmienna interpretacja
- Nieliczne: wątpliwa wartość (może być zanieczyszczeniem)
- Brak wzrostu: zwierzę prawdopodobnie wcześniej leczone antybiotykami lub nie mające znaczączenia
Wrażliwość na środki przeciwdrobnoustrojowe:
- Wrażliwe: możliwy dobry wybór do leczenia, jeśli środek przeciwdrobnoustrojowy może dotrzeć do tkanki docelowej
- Odporne: wybierz inny środek przeciwdrobnoustrojowy
- MIC: po wykonaniu MIC upewnij się, że wybrane środki przeciwdrobnoustrojowe osiągają wymienioną wartość MIC w narządzie docelowym
Histopatologia:
- Wynik dodatni: Silny związek z podejrzeniem choroby, jeśli jest w stanie wykazać zmiany jelitowe z E. coli przylegającymi do komórek nabłonka
- Wynik negatywny: brak zmian jelitowych
Genotypowanie:
- Genotypowanie jest konieczne, aby potwierdzić, że izolat ma niezbędne czynniki wirulencji związane z chorobą obrzękową
- Musi być F4 lub F18
- Musi mieć toksynę podobną do shiga (Stx2e)
Scenariusz postępowania
Świnie z biegunką poodsadzeniową:
- Pobrać wymazy z odbytu od 2 lub więcej nieleczonych świń z biegunką i poddać hodowli bakteryjnej, podatności na środki przeciwdrobnoustrojowe i genotypowaniu.
- Poddaj eutanazji 1-3 nieleczone świnie z biegunką. Natychmiast pobierz i umieść w roztworze formaliny 3 próbki jelit od każdego prosięcia. Zbierz świeże próbki jelit, schłódź w celu wykonania hodowli bakteriyjnej, wrażliwości na środki przeciwdrobnoustrojowe i genotypowanie.
