Dalsze zrozumienie różnorodności genetycznej i ewolucji wirusa grypy typu A grypy krążącego u świń (IAV-S) ma istotne znaczenie dla rozwoju skutecznych szczepionek i naszej wiedzy o zagrożeniach pandemią. Do tej pory niewiele było wiadomo odnośnie zróżnicowania IAV-S w Ameryce Łacińskiej, z powodu braku kontroli choroby.
Aby usunąć tę lukę, przeprowadzono sekwencjonowanie i analizę filogenetyczną hemaglutyniny (HA) 69 sekwencji z izolatów IAV-S zebranych od świń w Meksyku i Chile w latach 2010-2014, w tym podtypów H1N1 i H1N2, H3N2.
Nasza analiza zidentyfikowała kilka linii IAV-S, które po pojawieniu się i zaczęły krążyć przez dziesięciolecia. W ich skład wchodzą cztery nowe IAV-S, które nie zostały wcześniej zidentyfikowane w populacji świń na całym świecie, pochodzące od sezonowej grypy ludzi. Znaleźliśmy również dowody powtarzających się przypadków wprowadzenia pandemicznego wirusa H1N1 z człowieka na świnie w Meksyku i Chile od 2009 roku i zakażenia wirusami H1 i H3 z Ameryki Północnej, w Meksyku.
Ogólnie rzecz biorąc, nasze wyniki wskazują, że co najmniej 12 genetycznie odrębnych linii HA krąży w stadach świń Ameryki Łacińskiej, z których tylko dwa zostały znalezione w stadach świń Ameryki Północnej. Transmisja z człowieka na świnię, migracji przestrzenna poprzez przemieszczanie świń i genomowa reasortacja są kluczowymi mechanizmami ewolucyjnymi, które generują tę wirusową różnorodność. Potrzebna jest dodatkowe badanie antygenowe, a także sekwencjonowanie całego genomu, co pomoże zrozumieć występującą różnorodność i niezależną ewolucję IAV-S w Ameryce Łacińskiej.
Nelson M, Culhane MR, Rovira A, Torremorell M, Guerrero P, Norambuena J; Novel Human-like Influenza A Viruses Circulate in Swine in Mexico and Chile; PLoS Curr. 2015 Aug 13;7. pii: ecurrents.outbreaks.c8b3207c9bad98474eca3013fa933ca6. doi: 10.1371/currents.outbreaks.c8b3207c9bad98474eca3013fa933ca6.