0
Znaczenie mikroflory w przewodzie pokarmowym zwierząt uznaje się za kluczowy czynnik zdrowia gospodarza. Ostatnio uznano znaczenie mykobiomu, ale badania są n razie ograniczone, szczególnie u świń. Odsadzanie jest okresem stresu, zmian w diecie i predysponuje do infekcji, co czyni go punktem zainteresowania branzy trzody chlewnej. W tym badaniu pilotażowym staraliśmy się ocenić i scharakteryzować mykobiom w odchodach świń od urodzenia do okresu okołoodsadzeniowego, aby zbadać populację mykobiomu i jego dynamikę czasową w odchodach prosiąt.
Badania bakteriologiczne próbek kału wykazują znaczny wzrost obciążenia grzybami po odsadzeniu, który nie różni się od poziomów u dorosłych, co sugeruje stabilną kolonizację. Grzybów podatnych na hodowlę nie znaleziono w testowanych próbkach środowiskowych, w tym w wodzie, żywności, mleku lub siarze. Aby określić występującą różnorodność grzybów i rozwiązać problem grzybów, które nie wzrastają w posiewach, przeprowadziliśmy badanie pilotażowe wykorzystujące startery ukierunkowane na ITS i 16S rRNA do sekwencjonowania o wysokiej przepustowości odpowiednio gatunków grzybów i bakterii. Populacje bakteryjne zwiększają różnorodność w czasie eksperymentu (dzień 1-35 po urodzeniu), ale populacje grzybów nie wykazują tej samej tendencji czasowej. Po odsadzeniu następuje dynamiczne przesunięcie w posiewach do populacji zdominowanej przez Saccharomycetaceae. Zmiana populacji grzybów była spowodowana dominacją Kazachstaniaslooffiae, słabo scharakteryzowanego kolonizatora przewodu pokarmowego zwierząt.
Badanie to daje wgląd we wczesną kolonizację układu pokarmowego, a następnie kolonizację przez grzyby podczas okresu odsadzenia prosiąt. Przyszłe badania będą badać wpływ mykobiomu na wzrost i zdrowie prosiąt w okresie przejściowym.
Summers KL, Frey JF, Ramsay TG, Arfken AM. The piglet mycobiome during the weaning transition: a pilot study. J Anim Sci. 2019 May. https://doi.org/10.1093/jas/skz182
