Od grudnia 2010 r. odnotowano na dużą skalę biegunki u prosiąt ssących na terenie całych Chin, a szczepienia przeciwko PEDV były stosunkowo skuteczne w zapobieganiu tej biegunce. Jednak w lutym 2017 r. przypadki biegunki wystąpiły w stadach trzody chlewnej zaszczepionych przeciwko PEDV w Guangdong w Chinach. Wszystkie chore świnie miały ciężką wodnistą biegunkę, ale kliniczny początek nastąpił kilka dni później niż u świń zarażonych PEDV. RT-PCR przy użyciu specyficznych primerów dla PEDV, wirusa zapalenia żołądka i jelit, rotawirusa grupy A i deltakoronawirusa świńskiego, żadnego z tych wirusów nie wykryto we wszystkich próbkach klinicznych. Co więcej, ozdrowiałe lochy nie wykazały żadnych seroneutralizujących przeciwciał przeciwko PEDV.
W celu zbadania patogenów wywołujących ostatni epizod ciężkiej biegunki u prosiąt ssących, uzyskaliśmy kał od 32 chorych nowonarodzonych prosiąt z 3 gospodarstw. Dzieliliśmy 5-dniowe prosięta na 4 grupy po 5 sztuk . Każdemu zwierzęciu podano 5 ml odchodów drogą doustną. Po 2 dniach wszystkie zwierzęta wykazywały podobne objawy kliniczne, w tym biegunkę i odwodnienie. Po odczytaniu sekwencji i mapowaniu uzyskano kompletną sekwencję genomu szczepu GDS04 PEAV. Pełny genom szczepu PEAV GDS04 wykazuje duże podobieństwo nukleotydowe (≈95%) ze szczepami nietoperzy-HKU2 (bat-like). Nasza analiza filogenetyczna oparta na całym genomie GDS04 i przedstawicielach 4 rodzajów koronawirusów, w tym koronawirusów ludzkich i nietoperzy, wykazała, że GDS04 jest podobny do bat- like koronawirusów
Zaprojektowaliśmy specyficzne startery do wykrywania szczepu GDS04. Używając PCR z odwrotną transkrypcją, stwierdziliśmy, że 97 z 308 klinicznych próbek było dodatnich dla GDS04.
Podsumowując, przedstawiamy wstępne dane dotyczące wykrycia nowego wirusa podobnego do koronawirusa, PEAV. Uważa się, że PEAV jest odpowiedzialny za przypadki ciężkiej biegunki występujące w stadach trzody chlewnej w południowych Chinach. Trwa izolacja wirusa i testy serologiczne. Konieczny jest obszerny nadzór nad GDS04 PEAV, aby określić jego epidemiologię i ewolucję.
Gong L, Li J, Zhou Q, Xu Z, Chen L, Zhang Y, et al. A New Bat-HKU2–like Coronavirus in Swine, China, 2017. Emerg Infect Dis. 2017;23(9):1607-1609. https://dx.doi.org/10.3201/eid2309.170915