0
Przedstawiona praca opisuje wystąpienie ognisk epidemicznej biegunki swiń (PEDV) na terenie Stanów Zjednoczonych, a także pochodzenia, ewolucji i genotypów wirusa na podstawie dotychczas uzyskanych danych. Zostały także opisane zmiany histopatologiczne fragmentów jelita cienkiego świń dotkniętych chorobą, a także kompletna sekwencja genomu trzech szczepów z ognisk choroby na terenie Minnesoty i Iowa.
Analiza genetyczna i filogenetyczna trzech szczepów pochodzacych z ognisk choroby na terenie USA wykazało wysokie podobieństwo do szczepów chińskich PEDV i podejrzewa się, że stamtąd pochodzą. Szczepy PEDV wyizolowane w USA uległy jednak dywergencji i można je sklasyfikować w dwóch liniach bocznych. Te trzy szczepy okazały się być najbliżej spokrewnione ze szczepem wyizolowanym w chińskiej prowincji Anhui w 2012 roku. Analiza zegara molekularnego bazowała na kompletnych sekwencjach genomu i jest zgodna z rzeczywistą różnicą czasu od ognisk choroby w Chinach w grudniu 2010 roku z wybuchem choroby w maju 2013 roku w USA. Ponadto szczepy PEDV, które wywołały chorobę w USA dzielą pewne unikalne cechy genomu z koronawirusem nietoperzy w rejonie 5' nie ulegającym translacji, co skłania do stwierdzenia, że PEDV pochodzi od wirusa nietoperzy i może przenosić się między gatunkami.
Dane uzyskane w badaniu znacząco przyczyniły się do zrozumienia wystąpienia obecnych ognisk PEDV na terenie Stanów Zjednoczonych i stanowią wsparcie dla dlaszych działań mających na celu prewencję i kontrolę PEDV.
Yao-Wei Huang, Allan W. Dickerman, Pablo Piñeyro, Long Li, Li Fang, Ross Kiehne, Tanja Opriessnig, Xiang-Jin Meng. Origin, Evolution, and Genotyping of Emergent Porcine Epidemic Diarrhea Virus Strains in the United States. mBio vol. 4 no. 5 e00737-13. http://mbio.asm.org/content/4/5/e00737-13