0
W celu dokonania wielokrotnych porównań, wykonano sekwencjonowanie całego genomu 659 S. 4, [5], 12: i: - i 325 S. Typhimurium z różnych źródeł i lokalizacji (np. USA i Europa) w celu oceny ich genetycznej heterogenności, z naciskiem na szczepy pozyskane od świń ze środkowo- zachodniego regionu Stanów Zjednoczonych. Ponadto wykryto obecność genów oporności i innych czynników wirulencji i określono fenotyp oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe odpowiednio 50 i 22 izolatów od zwierząt gospodarskich i ludzi.
Szczepy S.4, 5,12: i: - tworzyły dwa główne klady, niezależnie od ich źródła i pochodzenia geograficznego. Większość (84%) izolatów z USA pozyskanych w latach 2014-2016, w tym te (50/51) pozyskane od świń w Środkowym Zachodzie USA, stanowiły część nowo powstającego kladu. W tym kladzie dominowały liczne determinanty genotypowej oporności, w tym oporność na ampicylinę, streptomycynę, sulfonamidy i tetracykliny (ASSuT). Odporność fenotypowa na enrofloksacynę (11/50) i ceftiofur (9/50) stwierdzono w połączeniu z obecnością genów opornościowych za pośrednictwem plazmidów (odpowiednio: qnrB19 / qnrB2 / qnrS1 i blaCMY-2 / blaSHV-12). Ponadto stwierdzono większe podobieństwo między S. 4, [5], 12: i: - z wyłaniającego się kladu i S. Typhimurium z Europy niż z S. Typhimurium ze Stanów Zjednoczonych.
Salmonella 4, [5], 12: i: - obecnie krążąca w populacjach świń w środkowym zachodzie Stanów Zjednoczonych jest prawdopodobnie częścią nowego wielolekoopornego kladu po raz pierwszy opisanego w Europie i może przenosić geny oporności oparte na plazmidzie, które mogą być przekazywane poziomo do innych bakterii i dlatego może stanowić problem dotyczący zdrowia publicznego.
Ehud Elnekave, Samuel Hong, Alison E Mather, Dave Boxrud, Angela J Taylor, Victoria Lappi, Timothy J Johnson, Fabio Vannucci, Peter Davies, Craig Hedberg, Andres Perez, Julio Alvarez; Salmonella enterica serotype 4,[5],12:i:- in swine in the United States Midwest: an emerging multidrug resistant clone, Clinical Infectious Diseases, , cix909, https://doi.org/10.1093