0
Charakterystyka genetyczna zespołu rozrodczo- oddechowego świń (PRRS) wykazała, że na świecie krążą obecnie dwa genotypy, europejski ( typ I) i północnoamerykański (typ II). Na końcu 3' genomu PRRSV (wielkości 15-kb) zakodowane są białka strukturalne.
W 2013 roku do Pracowni Diagnostyki Chorób Zwierząt, Departament Rolnictwa Ohio, trafiło sześć próbek krwi pochodzących od świń cierpiących na ciężkie objawy oddechowe.Wszystkie próbki były dodatnie na obecność PRRSV w teście real- time RT PCR. Wartości Ct badanych próbek wahały się między 15.85 a 28,38. Wirus następnie wyizolowano na linii komórkowej MARC-145. Po 4 dniach od zakażenie linii zaobserwowano efekt cytopatyczny. Dokonano także sekwencjonowania całego genomu wirusów. Analiza całego genomu wykazała, że szczep PRRSV (OH28372) jest w 92%, lub mniej, podobny do innych sekwencji dostępnych w GenBanku. Geny ORF5 szczepu OH28372 wykazały 96% podobieństwa do sekwencji dostępnych w GenBanku. Ponadto u OH28372 wystąpiła delecja 13 nukleotydów w rejonie 3' nie podlegającym translacji. Badania filogenetyczne wykazały zgodność z analizą genomu i wykazały, że OH28372 jest blisko spokrewniony z dwoma nowymi szczepami US (XW001 i NADC30).
Badanie to podkreśla znaczenie dalszego monitorowania ewolucji genomu PRRSV za pomocą sekwencjonowania.
L. Wang, Y. Zhang. Genomic sequencing and analysis of a new porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolate from Ohio: virus continues change. 2014 North American PRRS Symposium.
