0
Wirus afrykańskiego pomoru świń (ASFV) stanowi największe globalne zagrożenie dla hodowli zwierząt w historii. Pomimo jego znaczenia, niewiele wiadomo na temat mechanizmów i regulacji transkrypcji ASFV. Stosując metody sekwencjonowania RNA, ustaliliśmy całkowitą ilość RNA, miejsca rozpoczęcia transkrypcji i miejsca zakończenia transkrypcji na poziomie pojedynczego nukleotydu. To pozwoliło nam scharakteryzować motywy konsensusowe DNA wczesnych i późnych promotorów rdzenia ASFV, a także determinantę sekwencji poli-tymidylanowej do terminacji transkrypcji.
Nasze wyniki pokazują, że ASFV wykorzystuje alternatywne miejsca rozpoczęcia transkrypcji między wczesnymi i późnymi stadiami zakażenia oraz że ASFV-RNAP ulega poślizgowi transkrypcji z promotorem na prążkach na końcach 5 'jednostek transkrypcyjnych, dodając quasi szablonowe rozszerzenia AU- i AUAU-5' do mRNA .
Prezentujemy pierwsze bardzo potrzebne badanie całego transkryptomu obejmujące cały genom, które zapewnia unikalny wgląd w transkrypcję ASFV i służy jako źródło pomocy w przyszłych analizach funkcjonalnych genów ASFV, które są niezbędne do zwalczania tej wyniszczającej choroby.
Cackett, G., Matelska, D., Sýkora, M., et. al. The African Swine Fever Virus Transcriptome. Journal of Virology (2020). doi: 10.1128/jvi.00119-20