Optymalizacja stosowania środków przeciwdrobnoustrojowych w systemach zarządzania trzodą chlewną wymaga pełnego zrozumienia indukowanych przez drobnoustroje zmian w dynamice rozwojowej mikroflory jelitowej i rozpowszechnienia genów oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe (ARG). Celem tego badania była ocena wpływu wczesnej antybiotykowej interwencji na rozwój mikroflory kałowej oraz częstość występowania wybranych ARG (ermB, tetO, tetW, tetC, sulI, sulII i blaC TX-M) u nowonarodzonych prosiąt. Łącznie 48 miotów przydzielono losowo do jednej z sześciu grup terapeutycznych wkrótce po urodzeniu. Leczenie było następujące: kontrola (CONT), krystaliczny wolny kwas ceftiofur (CCFA), chlorowodorek ceftiofuru (CHC), oksytetracyklina (OTC), penicylina prokainowa G (PPG) i tulatromycyna (TUL). Wymazy z kału pobierano od prosiąt w dniach 0 (przed leczeniem), 5, 10, 15 i 20 po leczeniu. Analizę sekwencjonowania regionu hiperzmiennego V3-V4 genu 16S rRNA i wybranych ARG przeprowadzono przy użyciu platformy Illumina Miseq.
Nasze wyniki pokazały, że podczas gdy profilaktyka przeciwdrobnoustrojowa we wczesnym okresie życia nie miała wpływu na przyrost masy ciała lub śmiertelność, wiązało się to z niewielkimi zmianami składu mikroflory kałowej i zauważalnymi zmianami w ilości wybranych ARG. Miary odległości Unifrac wykazały, że zbiorowiska drobnoustrojów prosiąt, które otrzymały różne metody leczenia (CCFA, CHC, OTC, PPG i TUL) nie skupiały się wyraźnie do prosiąt CONT. W porównaniu z grupą CONT, prosięta leczone PPG wykazywały znaczny wzrost względnej ilości ermB i tetW w 20 dniu życia. Leczenie tulatromycyną skutkowało również znacznym wzrostem ilości tetW w dniach 10 i 20, a ermB w dniu 20.
Łącznie wyniki te pokazują, że zmiany w strukturze mikroflory kałowej spowodowane okołoporodową interwencją przeciwbakteryjną są nieznaczne i ograniczone do określonych grup taksonów drobnoustrojów. Jednak wczesna interwencja PPG i TUL na wczesnym etapie życia może promować selekcję ARG w stadach. Podczas gdy konieczne są dodatkowe badania w celu zbadania spójności tych wyników w większych populacjach, wyniki te mogą otworzyć drzwi dla nowych perspektyw w zakresie użyteczności wczesnego stosowania leków przeciwdrobnoustrojowych u zdrowych noworodków w systemach zarządzania świniami.
Zeineldin M, Megahed A, Burton B, Blair B, Aldridge B, Lowe JF. Effect of single dose of antimicrobial administration at birth on fecal microbiota development and prevalence of antimicrobial resistance genes in piglets. Front Microbiol. 2019 June. https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.01414